Находится в 1,5 км юго-восточнее села Манжерок, в негустом сосново-березовом лесу, слева, в 3 км от . Рядом с озером находится поселок Озёрное. Озеро расположено на высокой древней терассе правого берега . Уровень озера возвышается над Катунью на 88 м. Озеро Манжерокское имеет форму эллипса, длина озера 1112 м, наибольшая ширина 400 м, площадь 37,6 га. На основной площади глубина озера не превышает 2,5 м, максимальная глубина – 3 м. Дно илистое, вода пресная, мягкая, цвет – грязно-зеленый, температура воды в летнее время 22С.
В Манжерокском озере растут водяные лилии и реликтовое растение – чилим (чертов орех, водяной орех), занесенный в Красную книгу России. Его причудливые скорлупки с острыми рожками плавают по всему озеру. Незрелый орех не пригоден ни для каких целей, и рвать его категорически запрещается. Из рыб в Манжерокском озере обитают золотой и серебряный карась, линь, карп, щука и гольян.
На берегу озера ведётся строительство горнолыжного комплекса на горе Малая Синюха. Планируется установка нескольких кресельных подъемников австрийского производства, прокладка большого количества трасс разной степени сложности на южной и северной сторонах горы. Подъемник работает в летний сезон, что позволяет туристам осматривать живописные окрестности со смотровой площадки на вершине Малой Синюхи.
