Алтайский биосферный заповедник – одно из последних мест Горного Алтая, где еще сохранился лесной подвид северного оленя. На протяжении всего XX века его нахождение в заповеднике то подтверждалось, то ставилось под вопросом. Однако ученые доказали обитание этого животного на заповедной территории.
Ближайшие группировки оленя обитают в Саяно-Шушенском заповеднике и в заповеднике "Кузнецкий Алатау", находящиеся в значительном отдалении от территории Горного Алтая.
В 2007 - 2009 годы сотрудники Хакасского и Алтайского заповедников ежегодно совместно организовывали конные экспедиции с целью уточнения мест обитания северного оленя. В отчетах руководителя экспедиций сообщалось, что не было встречено ни самих животных, ни их следов. Уже считалось, что северный олень исчез с территории Алтайского заповедника.
В октябре 2012 года при вертолетном облете было обнаружено стадо из 27 особей. Нахождение лесного северного оленя на территории Алтайского заповедника было подтверждено
Летом 2015 года в